银行手续费的会计分录是财务费用。银行手续费记入财务费用科目。产生手续费，借记财务费用，贷记银行存款。
大多数企业将相互间拆借资金的利息计入“财务费用”，这种处理方法是不合适的。按照税收政策，非金融机构将资金提供给对方，并收取资金占用费（包括主管部门向所属企业拨付资金收取的资金占用费），均视为贷款行为。
业会计制度规定，列入“财务费用”核算的银行手续费，是指企业在筹集资金过程（如借款、发行债券、集资等）中所发生的相关融资费用。企业支出的银行手续费一般有两种情况，一是为企业筹集资金而发生的手续费支出；二是在银行结算过程中支付的手续费，如办理信（电）汇所支付的手续费、邮电费，购买空白支票、信汇单、汇票等所支付的工本费、手续费。
根据银行转回来的回单，直接计入财务费用
借：财务费用-一金融机构手续费
贷：银行存款
财务费用下一般设置利息收入、利息支出、金融机构手续费、汇兑损益。其中金融机构手续费可具体设置三级科目用来分别核算电汇手续费、银行卡手续费、分期付款收费、银行承兑汇票手续费以及其他手续费，其他手续费指的是买支票，询证，账户管理费等杂项支出。
手续费在银行系统分为两种：
一、除贷款以外的利息统称为手续费。如：信用卡分期还款产生的利息，信用卡逾期产生的利息；
二、在银行办理业务时产生的工本费。
从纳税角度来讲，经营者收取的各种代办手续费应作为应税收入，交纳增值税；扣除相关费用后的所得额，还须交纳企业所得税。另外有一种情况，就是为税务部门实施代扣代缴税金任务，所取得的代扣代缴手续费，属于免税收入，不需要缴纳营业税和其他税金。
借：银行存款 贷：其他业务收入 手续费收入
区别对待。通过银行转帐办理货款所发生的汇款手续费应该记入“财务费用-手续费”科目中.但购置福利用品（如食堂购物）汇款费记入“管理费用——福利费”。如果买支票就记入“管理费用-办公费” 如果是帐户不足一万元而缴纳的小额帐户管理费，就记入“管理费用-其他”
