解除劳动合同支付的补偿金入账的方式没有法律规定，通常情况下企业可以直接支付现金也可以通过银行账户转账实现。劳动者应当按照双方约定，办理工作交接。用人单位依照本法有关规定应当向劳动者支付经济补偿的，在办结工作交接时支付。《劳动合同法》第五十条用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。劳动者应当按照双方约定，办理工作交接。用人单位依照本法有关规定应当向劳动者支付经济补偿的，在办结工作交接时支付。用人单位对已经解除或者终止的劳动合同的文本，至少保存二年备查。第八十五条用人单位有下列情形之一的，由劳动行政部门责令限期支付劳动报酬、加班费或者经济补偿；劳动报酬低于当地最低工资标准的，应当支付其差额部分；逾期不支付的，责令用人单位按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金：（一）未按照劳动合同的约定或者国家规定及时足额支付劳动者劳动报酬的；（二）低于当地最低工资标准支付劳动者工资的；（三）安排加班不支付加班费的；（四）解除或者终止劳动合同，未依照本法规定向劳动者支付经济补偿的。
法律分析：补偿加班费、夜班补助、部分工资应通过“应付工资”来核算，对应的成本费用科目根据该人员原来情况核算。劳动合同解除的经济补偿金应记入“管理费用”科目。在正常经营情形下的支付的经济补偿金。
法律依据：《财政部关于对职工理顺劳动关系补偿金财务处理问题的复函》 企业在不改变企业组织形式或者未实施企业清算的条件下改革用工制度，因解除或变更劳动关系等而支付职工的经济补偿金，应计入发生当期管理费用，不应进行追溯调整。即此时应计入“管理费用”，贷记“现金”或“其他应付款”等科目，但不应通过“应付工资”核算。
根据《财政部、国家税务总局关于个人与用人单位解除劳动关系取得的一次性补偿收入征免个人所得税问题的通知》等文件的规定，具体如下：1、个人所得税：补偿金额在当地上年平均工资3倍以内的无需缴纳个人所得税，超出部分按照一次性所得缴纳个人所得税。2、企业所得税：符合上述个人所得税部分的金额，可以在企业所得税汇算清缴时，允许税前列支。借记“管理费用”贷记“应付职工薪酬”，支付时借：应付职工薪酬 贷：银行存款
法律分析：1、补偿加班费、夜班补助、部分工资应通过"应付工资"来核算,对应的成本费用科目根据该人员原来情况核算。
2、劳动合同解除的经济补偿金应记入"管理费用"科目。
法律依据：《中华人民共和国民法典》 第一千一百七十九条 侵害他人造成人身损害的，应当赔偿医疗费、护理费、交通费、营养费、住院伙食补助费等为治疗和康复支出的合理费用，以及因误工减少的收入。造成残疾的，还应当赔偿辅助器具费和残疾赔偿金；造成死亡的，还应当赔偿丧葬费和死亡赔偿金。
