事业单位会计和行政单位会计，虽然都是会计的一个分支，但也有一定区别。 行政单位和事业单位会计的主要差别有： 一、事业单位和行政单位会计主体和对象不同。事业单位会计是以事业单位实际发生的各项经济业务为对象，记录、反映和监督事业单位预算(年度财务收支计划)执行过程及其结果的专业会计，是预算会计的一个组成部分。行政单位会计是指中华人民共和国各级行政机关和实行行政财务管理的其他机关、政党组织等行政单位核算、反映、监督本单位预算执行情况及其结果的专业会计。二、适用准则不同。事业单位会计，要贯彻事业单位会计准则，而行政单位会计执行的是行政单位财务规则。三、会计制度不同。行政单位和事业单位各有各的会计制度，二者核算科目和核算内容有很大差异。
行政事业单位自2019 年1月1日起施行的是2017年10月24日财政部印发的《政府会计制度——行政事业单位会计科目和报表》(财会〔2017〕25号)。实施该准则是为了构建统一、科学、规范的政府会计核算标准体系，夯实政府财务报告的编制基础。
目前应该是收付实现制。但是以后慢慢会偏向权责发生制。 因为行政事业单位以后自负盈亏，慢慢就得实行权责发生制了。 以上内容仅供参考，谢谢！
《政府会计制度——行政事业单位会计科目和报表》适用于行政事业单位的政府会计制度。为了适应权责发生制政府综合财务报告制度改革需要，规范行政事业单位会计核算，提高会计信息质量，根据《中华人民共和国会计法》《中华人民共和国预算法》《政府会计准则——基本准则》等法律、行政法规和规章，我部制定了《政府会计制度——行政事业单位会计科目和报表》，现予印发，自2019年1月1日起施行。鼓励行政事业单位提前执行。执行本制度的单位，不再执行《行政单位会计制度》《事业单位会计准则》《事业单位会计制度》《医院会计制度》《基层医疗卫生机构会计制度》《高等学校会计制度》《中小学校会计制度》《科学事业单位会计制度》《彩票机构会计制度》《地质勘查单位会计制度》《测绘事业单位会计制度》《国有林场与苗圃会计制度（暂行）》《国有建设单位会计制度》等制度。
