资产类、基金类资产类 反映医院全部资产状况的总账科目，按资金的流动性强弱，分为“现金”、“银行存款”、“其他货币资金”、“应收票据”、“应收在院病人医药费”、“医疗应收款”、“其他应收款”、“坏账准备”、“库存物资”、“在加工材料”、“待摊费用”、“长期投资”、“固定资产”、“累计折旧”、“固定资产清理”、“在建工程”、“无形资产”、“待处理财产损益”等科目。负债类 反映医院全部负债状况的总账科目，按不同的债权人和债务类型，分为“医疗预收款”、“应付票据”、“应付账款”、“其他应付款”、“应付工资”、“应付福利费”、“应付社会保障金”、“应交药品收入”、“预提费用”、“长期应付款”等科目。基金类 反映医院全部基金状况的总账科目，按基金的用途，分为“事业基金”、“专项基金”、“待冲基金”、“收付结余”、“结余分配”等科目。收支类 反映医院全部收入和费用支出状况的总账科目，按收入的来源和支出和去向，分为“医疗收入”、“医疗业务成本”、“其他收入”、“其他支出”、“财政补助收入”、“财政补助支出”、“科教项目收入”、“科教项目支出”、“管理费用”、“投资收益”等科目。 医疗收入设置的一级明细科目为：门诊收入 提供门、急诊服务取得的各项收入。包括挂号收入、诊察收入、检查收入、治疗收入、其他收入等二级明细科目。住院收入 为住院病人提供诊察服务取得的收入。包括床位收入、诊察收入、检查收入、治疗收入，为门诊、急诊、住院病人的医疗服务中销售药品的收入，分别设置西药收入、中成药收入、中草药收入等二级明细科目。其他科目 会计科目的内容、记账方法、核算方法等，《医院会计制度》内均作了明确规定。
1、资产类：国库存款、其他财政存款、财政零余额账户款、有价证券、在途款、暂付款、与下级往来、预拨经费、基建拨款、财政周转金放款、借出财政周转金、待处理财政周转金；2、负债类：暂存款、与上级往来、已结报支出、借入款、借入财政周转金；3、净资产类：预算结余、基金预算结余、专用基金结余、预算周转金、国有资本经营预算结余、财政周转基金；4、收入类：一般预算收入、基金预算收入、国有资本经营预算收入、专用基金收入、补助收入、上解收入、调入资金、财政周转金收入；5、支出类：一般预算支出、基金预算支出、国有资本经营预算支出、专用基金支出、补助支出、上解支出、调出资金、国有资本经营预算调出资金、财政周转金支出。
在清单计价模式下，计入其他项目费。
